肛周脓肿选择手术治疗好，见效快。手术优点是脓肿一期治愈，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治愈率高。 深部脓肿一旦形成后，内部压力逐渐增大，这时应早期手术，不仅可使脓腔早愈，防止蔓延，而且也不易形成肛瘘，即使形成肛瘘，也比较容易治疗。因此，深部肛周脓肿须尽早手术。