输尿管结石堵塞输尿管后，肾盂内的尿液不能顺利经输尿管排出到膀胱时，会产生严重的肾绞痛。疼痛时由腰部向会阴部放射性的发作，患者坐立不安，难以忍受，可以出现肉眼血尿，除了腰痛症状之外，还可以伴随有恶心、呕吐等消化道症状，以及可能会有尿频、尿急等相关的症状，需要到急诊就诊，用止痛剂治疗。
常用的药物为非甾体类的抗炎药，如芬必得、泰诺林等，对于药物可以缓解疼痛，但是可能会对消化道产生一定的副作用。还可以用曲马多、杜冷丁、吗啡等强下到止痛剂，有些药物应用之后会加重恶心、呕吐，还可以应用黄体酮、山琅菪碱等M受体阻滞剂、坦索罗辛等α受体阻滞剂缓解疼痛，患者需要多饮水、多运动，促进结石排出。这种肾绞痛一般是阵发性发作，可自行缓解，或者服药缓解之后可以再次发作，最有效的缓解疼痛的方法，是结石自行排除或取出结石，可以通过体外碎石，输尿管支架植入，输尿管镜取石，可以快速缓解症状。但是患者如果合并发热、感染的迹象，尽快手术逆行置管，不宜行体外冲击波碎石和输尿管镜取石手术。