第一种类型，以功能性囊肿最为常见，主要是由于卵泡或黄体内积液量异常，形成卵泡囊肿或黄体囊肿。第二种，出血性囊肿也不少见，主要是由于卵泡囊肿和黄体囊肿生长过快造成卵巢阻力而裂开、出血，这些血液不出口而积聚在卵巢内的称为出血性囊肿。第三种类型是浆液性上皮囊肿和粘液性上皮囊肿。