凌晨五点咳嗽可能是呼吸道黏膜干燥、呼吸道感染、胃食管反流等导致，可以早晨起床多喝水、口服抗生素类药物或抑制胃酸的药物等。

1.呼吸道黏膜干燥

夜晚，张嘴呼吸，干燥的空气进入呼吸道，经过一夜时间，口表和呼吸道黏膜会变干，到了凌晨四五点，就会出现咳嗽，由于呼吸道黏膜干燥导致的咳嗽，可以在早晨起床时多喝水，也可以雾化吸入生理盐水来缓解症状。

2.呼吸道感染

晚上炎症成分会慢慢排出，从晚上到早上四五点钟，这些分泌物会堵塞气管，并对呼吸道黏膜造成刺激，引起咳嗽加剧。呼吸道感染导致的咳嗽，主要是要进行抗感染的治疗，可以口服抗生素的抗感染治疗，如左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素胶囊等消炎药物。

3.胃食管反流

因为人体的反流性屏障结构及功能的异常，导致夜间仰卧时，胃液容易反流，对支气管造成伤害。在凌晨四五点钟的时候，由于体内酸性物质的作用，导致咳嗽加重，如果不及时处理，甚至有可能导致吸入性肺炎。胃食管反流性咳嗽应选用抑制胃酸的药物，如雷贝拉唑钠肠溶片、泮托拉唑钠肠溶片等药物来帮助治疗。