毛细血管瘤的自然病程一般可分为以下3期：

增生期

毛细血管瘤的增生期多在6~8个月，亦有病例可长达一年多。刚开始多表现为蚊咬状或针尖样红点，也有出生时即为片状者。多在以后数月内向周围扩展，有的生长速度十分缓慢，有的则在数周内累及大片正常组织，并向深部扩展，破坏性强。体表病灶周围往往先出现卫星灶。以后与中心逐渐融合，也可呈多中心生长。有些患儿表现为全身多发病灶。

稳定期

本病通常在一岁左右开始进入稳定期，肿瘤生长停滞。此期病情稳定，时间长短各异。

消退期

当病灶中开始出现灰白点，并逐渐扩大或融合，皮下肿块开始软化时，即提示病程进入了消退期。肢体的毛细血管瘤消退比颜面部的速度要快，此类血管瘤自然病程的重要特点就是自行消退，其机制尚不明了，病理基础是幼稚的毛细血管变性，代之以纤维、脂肪组织。消退是一个漫长的过程，75﹪~80﹪的患儿在7岁时可达到完全自行消退，但也有消退率较低的报告，各种治疗手段的干扰使这一统计结果更加难以准确。