萎缩性胃炎治疗方法主要包括生活护理、药物治疗等，其治疗原则是针对病因，遵循个体化治疗，祛除病因、缓解症状和改善胃黏膜炎症，并需防止并发症，定期监测，防止恶变。
一、纠正不良的生活习惯，避免进食对胃黏膜有刺激性的食物。饮食要规律，少吃油炸、烟熏、腌制食物，不吃腐烂变质的食物，多吃新鲜的蔬菜和水果。患者应该戒烟戒酒，避免使用损害胃黏膜的药物。
二、根除幽门螺杆菌治疗。根除幽门螺杆菌可能有助于逆转轻度的胃黏膜萎缩和肠化生，推荐方案是铋剂加PPI加两种抗生素组成的四联方案。
三、促进胃动力，应用促动力药物，如多潘立酮、莫沙必利等改善胃动力，促进胃排空，有效缓解慢性萎缩性胃炎患者的腹胀、恶心等症状。
四、降低胃酸分泌，临床上常用的是质子泵抑制剂和氢受体拮抗剂，可有效改善胃酸对胃黏膜的损伤，消除上腹痛、上腹烧灼感等症状。
五、胃黏膜保护剂，如替普瑞酮、硫糖铝等，可以增强胃黏膜屏障功能，阻止损伤对胃黏膜的破坏，促进胃黏膜糜烂的愈合，适用于以上腹痛、上腹灼烧感为主要症状的患者。