子宫内膜异位症发病原因有月经血逆流、子宫内膜良性转移、体腔内膜的化生、遗传因素、免疫因素等。子宫内膜异位症发病原因目前还并不是十分清楚，但经过多年的研究目前有几个常见学说。一、月经血的逆流。临床上一般觉得月经血通过子宫腔，输卵管开口逆流到腹腔，内膜细胞就种植在卵巢、腹膜这些部位，逐渐形成散在的病灶。临床上也经常看到卵巢附近还有腹膜后穹窿的部位有散落的子宫内膜异位的病灶，这个情况和学说也是对得上的。二、子宫内膜良性的转移。有的学者认为子宫内膜是通过血液、淋巴液转移流向可能会种植子宫内膜的脏器，因为在临床上也有时能看到有的患者可能会出现肠管的子宫内膜异位病灶，或膀胱的子宫内膜异位病灶，甚至有的患者可能会出现鼻腔的子宫内膜异位病灶。这些病灶内会出现周期性的出血，这个学说也是根据这些症状来进行考虑的。三、体腔上皮的化生。认为子宫内膜的上皮在腹腔的各个部位慢慢化生形成一个病灶。四、遗传学说。有时子宫内膜异位有家族的聚集倾向。五、免疫学说。有炎症细胞因子可能会刺激引起疾病造成不孕不育。

正常子宫内膜应该长在子宫腔内，子宫内膜组织长在了子宫腔以外的部位时，称为子宫内膜异位症。子宫内膜异位症也简称为内异症，它可以生长在全身任何部位，通常最多发生在卵巢、子宫底主韧带。内异症的基本病理是异位的子宫内膜，也就是长在其他部位的内膜随卵巢激素变化而发生周期性出血，导致周围组织增生形成囊肿黏连。卵巢形成内异症是卵巢被异位的内膜侵犯，大约80%的病变是累积一侧卵巢，双侧的占50%。异位内膜在卵巢皮质内生长，跟随着月经周期每次也出血形成单个或多个囊肿，称为卵巢子宫内膜异位囊肿。囊肿表面呈灰蓝色，大小不一，直径多在5厘米左右，大的可以达到10~20厘米。典型情况下，陈旧性的血液积聚在囊内，形成咖啡色粘稠液体，好像巧克力一样，在临床上也叫做卵巢巧克力囊肿。因为囊肿周期性出血囊力压力增大，囊壁容易反复破裂，破裂后囊内容物刺激腹膜发生局部炎症反应，而组织纤维化造成与周围组织的粘连。粘连是卵巢子宫内膜异位囊肿的临床特征之一。

子宫内膜异位症的主要危害是痛经，不孕以及腹部包块。痛经是进行性加重，随着病情的延长，痛经逐渐加重。还有危害是不孕症，由于内异症引起黏连，排卵受到影响，内环境的改变会产生免疫性不孕，输卵管堵塞会导致受精卵不能进入到子宫腔内，会出现不孕症。

正常的子宫内膜是长在子宫腔里，子宫腔的内膜跑到了子宫以外叫子宫内膜异位症。子宫内膜异位症，如果它异位在肌层，就叫子宫腺肌症，所以它是同一个病，异位的地方不一样而已。子宫腺肌症是子宫内膜异位症的一个特殊方式，只是异位到了子宫的肌层，就叫子宫腺肌症，在临床上来讲，子宫腺肌症的方法有很多，主要是根据子宫腺肌症对病人造成了什么样的症状，来决定它的后续治疗；有的时候会造成月经量的增多、痛经。还要根据病人有没有生育的愿望，有没有保留子宫的要求，来处理子宫腺肌症。

由于子宫内膜异位症病因不明，从预防的角度上来讲没有确切的方法去预防。子宫内膜异位症有几种学说，比如内膜在位学说、经血逆流学说。对于内膜会进到肌层的学说，预防角度来讲，在月经期，女性可以可以通过锻炼的方法来预防。比如做瑜伽、健身等帮忙预防，但是像倒立的动作，在经期不建议做，瑜伽的特殊几个姿势，不建议去做。经血逆流学说里，根据动作来讲，倒立、其的动作有可能会减少内膜异位症的发生，包括少做流产、减少宫腔操作，都是预防方法。