胃间质瘤的手术方法根据肿瘤的大小、肿瘤的不同部位，有不同的治疗方法。如果肿瘤很小，小于两公分，而且向胃的腔内生长，可以用内镜切，就是用胃镜切掉。如果肿瘤再大一点，内镜切不了就用腹腔镜做局部切除，当然腹腔镜是一种办法，但也可以用开放的办法。开放手术做胃的局部切除，因为间质瘤的手术不同于胃癌的手术，胃癌的手术强调是淋巴结的清扫和大范围的切除；间质瘤本身有比较明确的边界，通常不发生淋巴结转移，所以这种肿瘤的手术，对切缘要求是只要是阴性就可以了；而且它不需要做大范围的淋巴结清扫，所以相对来讲手术方式跟胃癌是不一样的，相对简单一些。根据它的大小，部位的不同可以选择内镜切除，也可以选择局部切除。如果肿瘤发生在一些比较特殊的部位，比如说贲门或者幽门，这个时候如果不能做局部切除，就可能要做胃的部分切除。

胃间质瘤通常被认为是潜在恶性的肿瘤，即有恶性的可能。实际上胃间质瘤就是恶性肿瘤，它在小的时候，转移的几率比较小，但长到一定程度之后，转移的概率会变高。从它的生物学行为来讲，胃间质瘤就是恶性肿瘤，它的严重程度取决于几个方面：第一、取决于肿瘤的大小；第二、取决于它的肿瘤的生物学行为，包括核分裂象这些指标。如果发现的早，分期早，瘤就能治愈，恶性程度就低；如果发现的晚，有广泛的腹腔转移或者肝转移了，那治疗效果就很差了，属于晚期疾病，实际上就是胃间质瘤。

消化管道里的间质细胞如果发生恶性增生或者发生良性不断的不能控制的增生，叫做间质瘤，越大恶性度可能就越高。60%到70%的胃肠道间质瘤发生于胃，由于胃肠道间质瘤的症状不明显，又缺乏特异性，往往难以早期发现，强调早期诊断来定期的复查。

良性的胃肠道间质瘤通过手术切除，可以彻底治愈。恶性的间质瘤需要结合它的恶性程度，肿瘤分期，个人体质，有没有淋巴结转移，有没有脏器转移，手术能否彻底切除以及术后对于格列卫等化疗药物的反应情况，来确定预后的情况。

良性胃肠道间质瘤术后没有什么特殊处理，恶性胃肠道间质瘤，按照疗程进行化疗，定期复查。良性胃肠道间质瘤在腹腔镜下微创手术以后。恶性胃肠道间质瘤，需要做根治性的手术，如果有淋巴结或者是脏器转移，或者不能做手术，可以采用格列卫等药物遵照医嘱。