经过研究发现HLA-Ⅱ类的DR2、DR3与红斑狼疮的发病有很大的关系。在这两个遗传的基因携带者中，狼疮的发病是很高的。第二个原因就是感染因素和环境因素，在临床中发现有许多的红斑狼疮病人与感染有关系，包括病毒感染、细菌感染，以及其他的支原体、衣原体感染，感染导致人体的免疫系统的异常，造成免疫系统，比如T细胞、B细胞功能异常，产生很多的自身抗体，以及细胞因子。第三个就是一些情绪、心态的问题。在临床上可以发现很多的病人长期处于一个压抑的状态，很多人容易着急、生气，思想负担特别重，还有相当一部分人的睡眠不好，所以造成免疫功能的失调。另外一个原因是内分泌因素，红斑狼疮患病的女性多于男性，因为女性雌激素水平影响了人体的免疫系统。药物因素包括抗结核药、降压药等，有一种叫药物性红斑狼疮。