消化不良的原因总体来说不是特别的明确，目前认为和以下的因素是相关：第一个幽门螺杆菌的感染，目前认为幽门螺杆菌和消化道疾病密切相关，如果幽门螺杆菌阳性可以做HP根除治疗，这时症状会缓解一些，第二个饮食相关的因素，如豆类、肉类、蛋类或一些食物相关性的这些因素，进行食物过敏原检测或进食这些食物出现腹痛不适，建议先停掉，第三个是感染性的因素，有的患者出现胃肠道感染后，会遗留下腹痛、腹胀不适症状，第四个遗传背景相关的因素，如父母有一些特别的这些症状，那有可能孩子身上也会出现类似的症状，但位于哪个染色体、哪个基因靶向上目前没有定论。