在人体结构中，体内的一些疾病也会引起口臭。胃肠道疾病患者是导致口臭的主要因素之一，因为胃肠道疾病患者会出现一些消化性溃疡，从而导致呼出气体的气味。有些便秘、腹胀、厌食的患者，由于体内毒素的大量缺乏会引起口臭，许多女性在青春期都没有卵巢功能，身体素质低，也会引起口臭。