在怀孕早期，孕细胞分裂活跃很强，但功能未分化，对于毒性轻的药物，孕卵可以通过代偿继续发育，所以不会有很大的影响。但是毒性重的药物就会感染孕卵着床而导致流产。怀孕5-10周是胎儿胚胎器官发生期，细胞已高度分化，药物毒性容易杀伤细胞，而且无法代偿，导致胚胎产生形态以及功能上的畸形。畸形的类型与器官发育阶段以及用药的途径、剂量都有关系。