神经系统的先天性疾病包括以下几个方面：一是颅骨和脊柱畸形，如神经管闭合缺陷。二是神经组织发育缺陷，包括大脑皮质发育不良、先天性脑穿畸形、胼胝体发育不良、全脑畸形、颅神经疾病等；三是神经外胚层发育不良、结节性硬化等。第四，先天性肌病。第五，代谢功能障碍。六是言语功能的发展，包括先天性听力失语、先天性视觉失语。七是各种原因造成的智力低下。第八，脑瘫。第九，黄疸。