儿童肠系膜淋巴结结核的治疗主要是非手术治疗，但当并发肠梗阻或淋巴结穿孔引起腹膜炎时，需要手术治疗。应该注意营养，多吃蛋白质、维生素和铁质食物。并用抗结核药物治疗。膨胀淋巴结压迫腹部内脏产生相应症状，经内科治疗无效时，可考虑手术，解除压迫。干酪样坏死淋巴结可以去除干酪样物质。其余没有压迫症状的淋巴结一般不治疗。