空腹时体内血糖含量较低，此时跑步动用脂肪供能的比例会增大，从而可以消耗更多的脂肪。但是，问题也出在这里，由于空腹时人体内血糖水平较低，而血糖是大脑能量的唯一来源，空腹跑步会进一步减少血糖含量，使大脑缺乏必要的能量来源，因而容易导致头昏眼花，四肢无力，甚至晕厥等低血糖症。而血液中的游离脂肪酸虽能成为心肌等肌肉的能量来源，但是心肌使用脂肪酸的效率并不是很高，脂肪酸的量过多可能会引起各种心律失常，甚至猝死。